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【山東省】山東省農業科學院蔬菜研究所在洋蔥高密度遺傳圖譜構建及花薹高度相關SNP鑒定方面取得重要進展

2023-02-09

  近日,蔬菜研究所鱗莖類蔬菜育種與栽培創新團隊洋蔥課題組在Frontiers in Plant Science(IF=6.627;JCR1區,中科院2區)發表了題為“Construction of a high-resolution genetic map and identification of single nucleotide polymorphism markers relevant to flower stalk height in onion”的研究論文。

  洋蔥(Allium cepa L.)具有重要的園藝和藥用價值,其分布廣泛,南北各地均有栽培,是國內主栽蔬菜之一,也是出口創匯的主要蔬菜之一。由于洋蔥為二年生植物且其基因組龐大、重復序列較多、遺傳背景狹窄等原因,洋蔥高密度遺傳圖譜的構建和基于圖譜的基因挖掘工作一直落后于番茄等其他蔬菜作物。

  本研究利用洋蔥兩個雙單倍體(DH-1×DH-17)為親本構建的F2群體為研究材料,采用SLAF-seq技術構建了洋蔥高密度遺傳圖譜。該遺傳圖譜全長928.32 cM,平均圖距0.09 cM,包含8個連鎖群,10.584個多態SLAFs、21.250個SNP標記。利用該圖譜,首先對調控雄性可育性狀(Ms)的位點進行了QTL定位,定位結果與前人一致,說明該遺傳圖譜具有較高的質量。其次檢測到49個與花薹高度相關的SLAF標記,其中20個SLAFs被認為是花薹高度性狀雜種優勢的有效有利等位變異標記,可用于后期花薹高度相關基因或KASP標記的開發。本研究中構建的高質量高密度洋蔥連鎖圖譜為洋蔥花薹高度等重要農藝性狀的精細定位和候選基因鑒定奠定了基礎,也為洋蔥育種發育遺傳機制的研究提供了新思路。

  蔬菜研究所李艷偉博士為該論文第一作者,吳雄研究員和劉冰江研究員為該論文的共同通訊作者。該研究得到了國家蔬菜產業技術體系和山東省農業科學院農業科技創新工程的資助。原文鏈接:https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2023.1100691/full


2023年2月8日

來源:山東省農業科學院


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