人類遷徙活動是影響水稻遺傳演化的重要因素之一。侗族是中國古老的稻作民族之一，目前民族學和歷史學界對其族源及遷徙路線研究仍是學說各異。香禾糯是受侗族傳統飲食及農耕文化影響而被持續種植利用上千年的一類特殊生態型地方稻種，解析香禾糯優異特性形成的遺傳機制不僅對育種利用有重要意義，根據香禾糯遺傳演化規律揭示侗族的起源和遷徙更是一項具有創新思路的研究工作。
該研究團隊利用香禾糯和長江流域以南地方稻種，從基因組層面揭示香禾糯起源于廣西、廣東、福建和江西；結合民族學證據研究表明，后續香禾糯隨侗族祖先的遷徙而傳入黔東南。香禾糯與上述省份地方稻種之間存在顯著的基因滲入，預示著人類活動的干預。因此，該研究從基因組層面推測侗族族源來自于廣西、廣東、福建和江西，同時從香禾糯的多次基因交流和滲入揭示侗族在歷史上發生了多次遷徙事件。
該研究發現約350年前香禾糯與祖先群體發生遺傳分化，其有效群體規模約220-150年前達到頂峰；約150-120年前、30年前遭遇了馴化瓶頸，有效群體規模大幅下降，這分別與黔東南歷史上的“糯改粘”政策及雜交水稻大面積推廣事件相吻合。此外，基因組印記揭示香禾糯農藝性狀相關關鍵基因GS3、Hd1和DPS1以及耐冷相關關鍵基因LTG1和MYBS3是侗族選擇馴化的目標基因，其單倍型變化模式為香禾糯馴化動態過程提供了遺傳證據。該研究還發掘了一個穗粒數相關基因，可能對水稻增產發揮重要作用。
該研究得到了國家重點研發計劃、國家自然科學基金、中國農業科學院科技創新工程的支持。
原文鏈接：https://doi.org/10.1016/j.molp.2022.12.020
2023年2月15日
來源：中國農業科學院
