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中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院-接近完整的白菜基因組揭示著絲粒快速進(jìn)化特征

2023-02-21

  近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所分子育種創(chuàng)新團(tuán)隊研究獲得接近完整組裝的白菜基因組,揭示白菜著絲粒的快速進(jìn)化特征。相關(guān)研究成果在線發(fā)表在《植物生物技術(shù)(Plant Biotechnology Journal)》上。

  白菜是世界上栽培歷史最悠久的蔬菜作物之一,是我國栽培面積最大的葉用蔬菜。作為蕓薹屬作物中第一個完成基因組測序的物種,白菜參考基因組為白菜作物的基因組研究和遺傳改良奠定重要基礎(chǔ)。但是,目前的白菜參考基因組仍然存在幾百個缺口,其10條染色體的著絲粒結(jié)構(gòu)組裝均不完整。

  該團(tuán)隊利用三代測序技術(shù),獲得接近完整的白菜基因組。該基因組填補(bǔ)了白菜基因組中絕大多數(shù)缺口,完成了8條染色體從端粒到端粒的完整組裝,僅有2條染色體仍存在一個缺口;該基因組是目前組裝最為完整的白菜基因組。研究還發(fā)現(xiàn),著絲粒區(qū)域長末端重復(fù)序列的平均插入時間為14萬年,顯著晚于泛著絲粒區(qū)域,表明白菜的著絲粒區(qū)域經(jīng)歷著快速進(jìn)化。

  該研究得到國家重點研發(fā)計劃、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程項目等項目的支持。(通訊員:陳旭)

  原文鏈接:

  https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14015


  2023年2月16日

  來源:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所


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